鼠疫的最長潛伏期可以高達12天，不同的鼠疫潛伏期不同。原發性肺鼠疫的潛伏期可以從數小時到3天，腺鼠疫在2-5天左右。如果有預防接種的人，潛伏期會比較長。

最常見的是腺鼠疫，除了有腺鼠疫常見的表現之外，最主要的表現是受累部位的淋巴結腫大。肺鼠疫包括繼發性和原發性，主要表現是劇烈的胸痛以及咳粉紅色泡沫樣痰。最嚴重的類型是暴發性鼠疫，它的死亡率最高，也是最兇險的一類疾病。