強直性脊柱炎首選骶髂關節CT，若無法看出，做骶髂關節的核磁共振就能看出。核磁共振對骶髂關節的急性骨髓水腫，還有滑膜增厚，即急性骶髂關節的急性破壞，特別是滑膜、肌腱、韌帶，可較為清晰看到並分辨，比CT分辨率更高。

骶髂關節CT能夠看到的主要為骨質破壞以及骨質毀損，如骨質的骶髂關節硬化、蟲蝕樣改變、骶髂關節硬化、毛糙以及間隙變窄等，都可通過CT看出。更精細的病變需通過核磁共振看出，尤其當骶髂關節急性期時骨髓水腫，表現為強直性脊柱炎急性改變，分辨率比CT更清晰。