若為單純良性脂肪瘤，即便切除範圍較大，但仍為小手術，因其可在局麻下進行。手術時可將切口切得較大，若脂肪瘤較大而傷口過小，可導致取出腫瘤時操作不便。

醫生需注意避免在皮下形成空腔，一旦形成空腔，易脂肪液化形成積液，長時間無法吸收。雖通常在3-6個月可吸收，但相對較慢且會出現鼓包，甚至需要穿刺抽液。

若為脂肪肉瘤，即惡性脂肪瘤，需要進行擴大切除，即做R0切除，為較大手術。醫生需在距離腫瘤5cm處上下左右進行完全切除，不但需切除腫瘤，還需切除筋膜組織、肌肉、腹膜組織，才可達到治療惡性腫瘤效果。