絕大部分脂肪瘤通常不會癌變。脂肪瘤屬於軟組織病變，雖然不會癌變，但有可能會惡變成為惡性腫瘤，稱為脂肪肉瘤。若脂肪瘤在短時間內長大、質地變硬、突然變疼，或是邊緣出現紅腫、邊緣界限不清楚，則可能是惡變的傾向，不過只有少部分脂肪瘤有惡變傾向。

判斷病變是否癌變，可以根據組織來源區分，癌是指一些上皮細胞的病變，如腸黏膜的細胞癌變後稱為腸癌，胃黏膜上皮細胞病變後稱為胃癌。而來源於間葉組織細胞的病變，則稱為非癌變，即惡性腫瘤。