囊腫和脂肪瘤均為臨床常見的良性疾病，但二者有不同的臨床表現，區別主要如下：

1、內容物性質不同：囊腫的內容物多為液體，如皮脂腺囊腫多為豆腐渣的物質，而脂肪瘤的成分是脂肪顆粒；

2、影像學表現不同：囊腫沒有回聲區，而脂肪瘤表現為低迴聲區；

3、疾病的發生部位不同：脂肪瘤通常發生於四肢、後背或頸部，表現為邊界清楚、質地柔軟的包塊。深部脂肪瘤可以沿著肌肉生長達到骨膜，但較少臨近骨骼。而囊腫可以發生在全身的各個組織、臟器，如肝囊腫、胰腺囊腫、脾臟囊腫、腎囊腫、乳腺囊腫、甲狀腺囊腫、單純的卵巢囊腫以及巧克力囊腫；

4、疾病的治療方法不同：對於無臨床症狀的脂肪瘤患者，或者乳腺囊腫、腹腔內的臟器囊腫直徑不超過2cm時，均無需特殊處理，定期觀察隨診即可。而當脂肪瘤、囊腫較大或者出現局部壓迫，患者存在隱痛症狀時，均可以進行手術切除，而部分乳腺囊腫的患者口服藥物後可以自行緩解。