體檢發現肝囊腫，明確診斷之後患者可以定期予以複查，如果囊腫的最大直徑＜5cm，可以考慮繼續予以觀察，如果肝囊腫的最大直徑＞5cm，需要根據囊腫的部位，進行超聲引導下的穿刺引流，或者在腹腔鏡下進行囊腫的去頂引流。在手術治療之後，還要及時複查血常規、肝功能。

對於體檢過程當中發現肝囊腫的患者，首先要進一步明確囊腫的性質，是單純的囊腫還是考慮有肝臟部位的寄生蟲病，例如肝包蟲病。另外，對於部分老年患者來說，還要進一步排除是否有肝臟部位的轉移性腫瘤，必要的情況下需要進行上腹部的核磁共振檢查。