肝囊腫通常不會自愈，肝囊腫是肝內單發或多發的囊性病變，可包括單純性肝囊腫和多囊性肝病。大多數肝囊腫是肝臟的良性病變，因體積較小，不會影響到人體和肝臟的生理功能，通常沒有自覺症狀，但病變也不會自行消退。此類患者一般無需特殊治療，定期複查即可。在逐漸生長到影響肝臟功能或出現壓迫局部組織的症狀時，可考慮選擇藥物、硬化治療或手術治療等。

部分先天性肝囊腫發展較慢，可持續幾十年不見發展，無需進行特殊治療處理。但患者的肝囊腫並非消失，只是沒有明顯威脅到身體健康而已。如部分患者的肝囊腫較重，如生長較快、囊腫較大、伴發感染、出現肝區隱痛、噁心、嘔吐、黃疸、腹水、肝腫大等伴發症狀的，需及時接受治療。常見的治療方式包括：

1、藥物治療：如有炎症的患者可選擇適合的抗生素進行治療；

2、硬化治療：指向肝囊腫內注入適量的無水乙醇，達到囊腫自行壞死、消失的作用，但其效果一般，複發率較高；

3、手術治療：治療效果比較好，一般以肝囊腫開窗去頂引流術或肝部分切除術為主，複發率相對較低。但一般不建議單純性肝囊腫穿刺引流術，其複發率比較高。

因個體差異較大，患者出現肝囊腫時，無需過度緊張，建議積極前往醫院進行就診，並進行針對性治療。在醫生的指導下，選擇適合自己的治療方式。及早進行處理能夠避免病情延誤，以免肝囊腫的持續發展，導致患者出現較嚴重臨床症狀等。