枕骨大孔疝是臨床上比較危急的腦疝，發生後患者可能會在較短的時間內出現心跳、呼吸不規律，甚至出現心跳、呼吸停止。對於發生枕骨大孔疝的患者，一方面應該緊急地予以生命支持，例如使用血管活性藥物、進行氣管插管、呼吸機輔助呼吸。另一方面，應該快速的靜脈輸入甘露醇等脫水藥物，為進一步的診斷和治療爭取時間。

對於病因尚不明確的患者，在快速輸入甘露醇等脫水藥物，生命體徵基本穩定的情況下，應該儘快進行頭顱CT檢查，明確引起患者枕骨大孔疝發生的原因。在進行基本的生命支持，以及快速輸注脫水藥物等治療之後，如果患者的腦疝情況暫時穩定，生命體徵基本穩定的情況下，則應該根據CT檢查結果，儘可能通過手術的方式清除顱內病變。只有把引起大孔疝的病灶加以清除，才有希望使患者的神經功能得到進一步恢復。

枕骨大孔疝是臨床上的急危重症，如果患者已經出現了心跳、呼吸停止，並且在使用血管活性藥物等進行支持的情況下，患者的生命體徵仍然不穩定，有可能會喪失進一步治療的機會。