谷氨酰轉肽酶和鹼性磷酸酶高不一定是肝癌。谷氨酰轉肽酶和鹼性磷酸酶升高，多提示存在肝膽系統疾病，肝臟疾病，如急性病毒性肝炎、慢性肝炎、肝硬化、酒精性肝炎、藥物性肝炎、脂肪肝、肝膿腫等，都可能導致肝細胞壞死、肝功能受損，從而，對谷氨酰轉肽酶和鹼性磷酸酶代謝造成影響，導致其出現升高。

此外，各種肝內外膽管阻塞性疾病，如膽囊炎、膽道結石、肝內外膽汁淤積、硬化性膽管炎、胰頭癌、原發性膽汁性肝硬化等，也可導致谷氨酰轉肽酶和鹼性磷酸酶升高。肝臟分泌的膽汁主要儲存在膽囊中，一旦膽囊、膽管出現疾病，會導致膽汁進入人體血液循環，造成谷氨酰轉肽酶和鹼性磷酸酶升高。因此，谷氨酰轉肽酶和鹼性磷酸酶升高不代表是肝癌。