原發性肝癌主要指原發性的肝細胞性肝癌，其診斷包括臨床診斷與病理診斷，主要如下：

1、臨床診斷：首先應詢問患者是否存在肝炎病史，包括乙肝、丙肝、酒精肝、脂肪肝等病史。另外，臨床表現為肝區疼痛、肝腫大的患者可以通過實驗室檢查甲胎蛋白來檢測原發性的肝細胞性肝癌，近年研究發現，異常凝血酶原PIVKA的升高對肝癌的診斷具有一定意義；實驗室檢查包括B超、CT、磁共振等方法，建議患者先通過超聲觀察肝臟的佔位，然後通過CT平掃或增強觀察患者肝臟佔位的性質、部位。還可以通過PET-CT觀察腫瘤是否存在肝內其它部位轉移；

2、病理診斷：主要依靠組織活檢，即通過穿刺取出腫塊標本，使用顯微鏡觀察確定，且病理診斷為確診肝癌的金標準。