肝囊腫屬良性疾病，多數肝囊腫大小在1-2cm，不影響肝臟功能，不影響生活及壽命，對人體無影響，囊腫較為穩定，不會增大，所以無需治療。

但部分肝囊腫較大達到十幾釐米，部分造成肝臟壓迫、肝實質壓迫或造成其它器官和組織壓迫，此種情況需要治療。一般進行腹腔鏡微創手術進行開窗引流，創傷較小，治療效果較好，一般術後1-2天即可出院，手術較為安全。