多發性肝囊腫是一種良性病變，一般會合並其他器官囊腫，如腎臟囊腫，稱為多囊腎。囊腫一般都是先天存在，囊腫的界較清晰，囊腫內儲存的囊液一般不會在臨床上發現，在體檢做超聲時偶然發現。囊腫可分佈在肝臟各個肝段，也可侷限在膽道內。囊腫液體隨著囊腫類型、大小、併發症等發生改變，絕大多數情況下，多囊肝囊液是澄清的。

若囊內出血，囊液會呈棕色或紅色。若出現感染，囊液會表現為膿性。臨床表現上，一般囊腫都在40歲-50歲後才有可能出現臨床症狀，和囊腫大小有關。其主要表現為消化道症狀，如消化不良等。若囊腫出現壓迫膽總管或肝管，還有可能出現黃疸情況。當囊腫出現壓迫器官時，需進行手術治療。