肝囊腫實際是先天形成的肝臟內囊性改變，在肝臟裡形成大小不等的囊泡，裡面有囊液。在非常嚴重的情況下，可以因為先天遺傳問題出現先天性腎囊腫，同時伴有肝囊腫。在這種情況下肝臟和腎臟的囊會比較多，而且這些囊會逐漸增大，乃至危及患者的生命，出現腎衰竭和肝衰竭。
但是大部分患者的肝囊腫都是先天形成，相對比較良性的疾病，患者不必過於擔心。只有在囊腫比較大，引起肝區不舒服，或者肝內囊腫容易破裂的時候，才給予相應的處理措施。大部分情況下，只需要定期複查就可以。