兒童肝囊腫其實和成人肝囊腫大部分情況下都是先天發育的問題，不需要特別關注。因為大部分的肝臟囊腫都比較小，而且數量也不會特別多，這種情況定期複查就可以，因為肝囊腫一般也不會惡變。
但是要特別小心出現肝臟囊腫合併腎臟囊腫，有可能是一種常染色體顯性遺傳，就是遺傳性的肝、腎囊腫疾病。在這種情況下要特別小心，因為這種肝和腎的囊腫會越出越多，會導致腎功能的衰竭。
如果進一步增大，肝囊腫可以出現感染，會壓迫肝實質的細胞，肝實質的細胞會壓迫膽管，出現相應的肝臟和腎臟損傷的表現。在這種情況下可能要特別小心，但是一般情況下只需要定期複查就可以。