多數人在體檢時，B超會發現肝臟上有囊腫，囊腫的大小不定，因為現在B超機器越來越精細，發現的囊腫越來越小，過去可發現2cm以上的囊腫，現在有時會發現<1cm的，有時體檢報告零點幾公分，都可以給報出來。
大部分的肝囊腫都是單純性肝囊腫，這種囊腫不需要治，不會產生症狀，也不會產生癌變。所以對於這些囊腫，往往是觀察即可。至於多大的囊腫才需要治療，臨床上沒有明顯界限。一般認為如果囊腫>10cm以上，或者囊腫因為較大，壓迫到周圍器官，比如壓迫胃，或者壓迫膽道等，給病人產生一定症狀時，再考慮進行治療。可以進行穿刺治療，穿刺之後在裡面輸入無水乙醇，毀損其內膜，更徹底的治療是腹腔鏡下開窗引流進行治療。