肝內膽管細胞癌和肝細胞癌存在區別。肝內膽管細胞癌的發病率並不高，主要與肝內膽管結石、硬化性膽管炎等有關。一般發生在二級膽管以上，包括毛細膽管，在膽管上皮發生的腫瘤即為肝內膽管細胞癌。

肝細胞癌是肝細胞異常增殖引起的肝癌，在肝癌中佔90%，因此肝癌一般指肝細胞癌。該病發病率較高，可能與乙型肝炎、丙型肝炎等有關。另外，食用含有黃麴黴菌的食物也可引起肝細胞癌。肝細胞癌是發生率處於第三的腫瘤，且轉移較早，腫瘤周圍存在增生的血管。臨床上此類患者可以選擇介入治療的方法，效果較為理想。