患者腦膿腫晚期，如果全身的健康狀況可以耐受全麻手術，有希望進行治療。

特別是由於腦膿腫和周圍水腫引起腦疝，患者沒有出現雙側瞳孔散大、生命體徵不穩定或者全身的健康狀況，難以耐受麻醉等嚴重情況，有希望進行救治。對於單房較大的腦膿腫，可以進行急診穿刺抽吸，將大部分膿液抽吸出來，患者膿腫引起的佔位效應、顱內壓增高能明顯減輕，患者的腦疝也能恢復，有救治希望。

如果患者腦膿腫已經破入硬膜下腔，造成瀰漫的硬膜下積膿或者向內脫落到腦室系統，造成腦室系統積膿，此時救治希望十分渺茫。因為硬膜下積膿、腦室性的積膿部分情況下，患者的死亡率可高達半數以上，雖然可通過臨床積極救治，但是患者的總體預後並不樂觀。所以患者一旦發現腦膿腫，建議進行積極的手術治療和藥物治療，可能有希望恢復。