晚期膀胱癌的主要治療方式是全身治療即化療。目前中期膀胱癌，在手術前也會給進行新輔助化療。因為國外研究已經證實，採用新輔助化療可以延長患者生存。對於有根治性膀胱全切後的患者，根據患者病理情況輔助進行化療。部分患者要保留膀胱，應該進行全身化療。
總體而言，全身化療在膀胱癌的應用比較廣泛，目前常用的全身化療方案有MVAC方案、GC方案。相對在國內GC方案用的較多，副反應相對較小。
GC方案採用化療藥物主要是吉西他濱及順鉑，採用GC方案化療主要副作用包括對骨髓的影響，又稱骨髓抑制，患者可能出現白細胞、血小板等減少，可以通過術後化療後用升白針或升血小板的針劑，幫助預防副反應發生。此外GC方案化療可以引起肝功能異常，可通過一些護肝藥來對患者進行治療，還會出現胃腸道的副反應，包括噁心、嘔吐、腹瀉、便秘等以及脫髮情況。還有一些少見併發症，包括神經系統異常、皮膚感覺異常等。