艾灸治療抽動症作為一種輔助療法，效果較好，但艾灸選穴也無法離開中醫辨證論治理論指導，但需堅持治療。艾灸位置需有所側重，如果定位在肝、心、脾，痰溼型或痰熱內擾，則可清肝經配合小兒推拿，如清肝經、刮痧肝經的同時，艾灸化痰穴位，如艾灸豐隆穴、陽陵泉穴，也可以艾灸背部肺俞穴、肝俞穴進行配合治療。

另外，而艾灸還可選用足底的湧泉穴，讓患兒將腳勾起，腳底前面凹陷即湧泉穴，可以艾灸湧泉穴將火向下引。因為抽動症的主要表現出現在上半身的頭面部分，如果將火向下引，引入腎水，也能減輕、減少抽動的發作。