小兒抽動症的發病原因較多，屬於兒童行為的異常性疾病。目前病因不清，很多研究認為是多因素疾病，與先天因素、後天因素、環境因素、遺傳因素、感染因素、生活環境都有很大關係。除少數患者會遷延不愈外，多數患兒預後良好。部分患兒隨年齡增長，病情會逐步減輕或症狀侷限化，說明該疾病存在一定自愈性，但自愈率比例偏低，特別是慢性抽動障礙和抽動穢語綜合徵患兒，病程在1年以上者自愈率更低。

抽動症患兒在成年期存在三種結局，近半數患者病情得到緩解，有30%-50%的患兒症狀減輕，有5%-10%的患兒病情遷延不愈，到成年期還會存在，症狀一般不會進一步加重。所以患有抽動症兒童應該積極治療，對預後有很大影響。