小兒抽動症的檢查屬於排他性檢查，有相對比較典型的臨床表現，一般考慮抽動症的可能。當然，必須要排除其它疾病，如要做腦電圖，排除癲癇對應的腦性疾病。要做影像學檢查，如頭顱CT、磁共振等，排除顱內佔位性疾病或結構性疾病。

此外，還要做生化方面的檢查，排除舞蹈病或肝豆狀核變性等，在排除上述疾病以後通常就可能通過特別的檢查手段診斷小兒抽動症。總之，小兒抽動症檢查包括常規生化檢查、頭顱CT檢查、頭顱核磁共振、腦電圖等方面的檢查。