功能性胃腸病的原因如下：

1、胃腸動力異常障礙：應首先到醫院排除器質性病變，尤其要排除幽門螺桿菌感染引起的疾病。臨床常表現有打嗝、易飽、腹瀉、便秘等症狀；

2、精神因素：腸道疾病可引發腸腦軸變化，繼而引起腦神經內分泌異常，導致失眠、易怒、精神異常，及腸道的菌群失調；

3、社會環境因素：飲食不規律、壓力大、情志失調等都可造成功能性胃腸疾病。