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生化妊娠是指精子和卵子結合後被運輸到子宮腔內，並在子宮腔的內膜種植，在超聲能夠看到前停止發育，約佔早期流產的2/3。引起生化妊娠的原因有很多，不只是卵子和精子的問題，其他方面的問題，包括母親疾病、環境因素等都可以導致生化妊娠。 正常情況下，精子與卵子在輸卵管內結合成受精卵後不斷地分列增殖，在輸卵管纖毛上皮細胞的纖毛擺動和輸卵管蠕動下向宮腔方向運行，第四天進入宮腔，並著床進入子宮內膜。受精卵一般在受精後第6-7天著床，並開始分泌人絨毛膜促性腺激素（HCG），著床後的胚胎不斷地分裂增殖，發育成囊胚。而生化妊娠主要是胚胎著著床經歷定位、附著及植入3個階段，其中任何環節出現問題，都可能導致著床失敗或著床後停滯細胞的分裂增殖，進而發生生化妊娠或流產。因此，精子問題只是引起生化妊娠的其中一個因素。有研究表明，男性的年齡及精液質量與生化妊娠的發生有關。 生化妊娠的發生與子宮內膜厚度、母體激素水平、 卵子質量、胚胎染色體、母體年齡、既往有生化妊娠或流產史、母體免疫因素、男性年齡和精液質量等有關，精子問題只是其中一個原因。一般生化妊娠患者不自知，以為是正常月經來潮，並且生化妊娠的發病原因也不易查明。生化妊娠不影響下次懷孕，只有反覆生化妊娠的孕婦需要檢查生化妊娠的原因並需要進行治療。
妊娠甲亢又稱妊娠甲亢綜合徵，懷孕時由於人絨毛膜促性腺激素，即HCG水平較高，常位於8萬-9萬以上，而HCG與甲狀腺中的TSH受體發生交叉反應後，會引起甲狀腺激素合成增加，出現甲亢。
孕婦三碘甲腺原氨酸高可能是生理需要，需要檢查妊娠期患者甲狀腺功能。三碘甲腺原氨酸即T3，在妊娠期，尤其是孕早期，為促進胎兒神經系統發育，孕婦遊離T3、遊離T4、總T3、總T4需要保持在正常值上限，甚至比正常值 上限略高。所以孕婦三碘甲腺原氨酸單純增高，屬於妊娠正常現象。
妊娠期間TSH就是促甲狀腺激素，一直會有波動變化，主要是區分相應的時間段，在懷孕12周以內，TSH的正常值範圍是0.1-4.0mU/L，而妊娠早期12周以內HCG值升高，TSH與HCG之間會有部分的作用，即HCG值升高，TSH就會緩慢降低。孕早期TSH值降低並不可怕，因為TSH降低主要是偏向生理性的甲 亢狀態，在妊娠早期12周以內，孕婦本身會存在生理性的甲亢狀態。
TSH在孕12周以內＜0.1mU/L，在12-28周之間＜0.2mU/L，在28周之後＜0.3mU/L，在臨床上通過內分泌科會診就可以考慮患者合併妊娠甲亢，應該積極治療。在妊娠期間如果是促甲狀腺激素即TSH偏低，即甲亢對於孕媽和胎兒具有一定的影響，嚴重的甲亢會導致孕婦出現甲亢型的心臟病。如果胎兒處在高甲狀腺素的狀態內，胎兒本身甲狀腺功能可能也會受到抑制，其生長發育甚至在妊娠期間容易出現危險，進而導致流產、早產。
妊娠期間需要檢查促甲狀腺激素，即TSH。因為甲狀腺功能與孕婦和胎兒息息相關。在妊娠中期12-28週期間，TSH數值應該在0.2-3.0mU/L，與正常非妊娠期間人群的標準值不同。在孕早期即妊娠少於12周，TSH在0.1-4.0mU/L，在12-28週期間，即孕中期應該TSH是0.2-3.0mU/L，在孕晚期應是0.3-3.0mU/L。
懷孕後引起的甲亢能否自愈應具體問題具體分析，不可一概而論。懷孕早期，由於胎盤分泌較多絨毛膜促性腺激素，絨毛膜促性腺激素可以作用於甲狀腺細胞，產生過多的甲狀腺激素，從而導致甲亢，此時稱為一過性甲亢。
甲狀腺是人體非常重要的內分泌器官，呈蝴蝶狀，在頸部兩側包繞氣管，受下丘腦-垂體-甲狀腺軸調節，主要分泌甲狀腺激素。甲狀腺激素是甲狀腺中的濾泡細胞分泌，包括四碘甲狀腺原氨酸和三碘甲狀腺原氨酸，即通常所說的T4和T3，能促進新陳代謝，維持生長發育，提高神經系統興奮性，是產熱激素。
懷孕期間發現甲亢，原則上可以繼續妊娠。相對於正常的孕婦，甲亢的孕婦容易出現流產、早產、胎兒發育遲滯等。因為孕婦服用抗甲狀腺的藥物可能會導致胎兒甲減，因此需要更嚴密地監測甲狀腺功能，在內分泌醫生的全程指導之下，規律服用抗甲狀腺的藥物，而確保母子平安。
孕婦甲功高對胎兒不一定有影響，即並非是妊娠期甲狀腺功能亢進，多數為一過性。由於妊娠早期雌激素水平增高，肝臟合成甲狀腺結合球蛋白增高，進而引起甲狀腺激素、三碘甲狀腺原氨酸水平增高。另外，胎盤分泌的絨毛膜促性腺激素 ，也可以引起甲狀腺激素水平增高。
不孕不育分為女性和男性不孕不育，不能成功懷孕的稱不孕症，種種原因流產、死胎的稱不育症。女性甲亢常出現月經減少甚至閉經，男性甲亢會出現陽痿、性功能減退的狀況。甲亢還可以影響男子的精子生成，造成無精子症。女性甲亢多發生在育齡，甲亢沒有治癒時孕婦可以造成先兆子癇、充血心衰、甲亢危象、妊娠高血壓、胎盤早剝等，危及胎兒甚至可以造成死胎、早產、先天畸形、宮內生長發育遲緩。妊娠期甲亢還可以引起胎兒或新生兒甲亢。鑑於這種情況，為孕婦和胎兒的健康、為保證孕婦和胎兒的安全，還是要等到甲亢治癒後再懷孕。如果妊娠期間發現甲亢，並且選擇繼續妊娠，原則上是進行抗甲亢藥物治療，或可以在妊娠中期進行手術治療。所以臨床常有甲亢合併妊娠的患者，由於抗甲亢藥物對胎兒有致畸作用，需要根據情況和醫生共同討論治療方案。孕前如有碘-131治療，需要避孕半年方可妊娠，如果甲亢得到控制，病情穩定，生育功能也隨之恢復，可以懷孕。