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液氮冷凍是治療扁平疣的一種常用方法，在臨床上經常會用到。一般在液氮冷凍以後，首先會於3-5天之內進行結痂，有的甚至還會起水皰，待水皰逐漸乾涸後結痂。故結痂一般是經過一週左右的時間，待痂脫掉以後，就會留下色素沉著斑或者色素減退斑，在臨床上呈現為褐色的斑片或者白色的斑片。這種斑片恢復的時間比較長，在臨床上通常需要三個月，甚至最長需要半年，才能夠恢復到原樣。
扁平疣是皮膚科比較常見的一種病毒感染性的皮膚問題。主要是由HPV毒感染引起。特點是在局部出現皮膚顏色或者淡褐色的多角形的扁平丘疹，有的部位可以看到類似於同形反應樣的串珠樣表現。儘管以往認為扁平疣可以自行消退，但是對於絕大多數的扁 平疣，臨床觀察可以見到，即使是過了10-20年，仍然會持續存在在皮膚局部，呈現比較穩定的狀態。只有個別的穩定狀態的扁平疣可進入了進展期，短期內局部出現快速的疣體增多、擴大，同時伴有明顯的瘙癢。此階段，如果及時的用藥治療處理，則有可能出現快速的消退。除此之外，穩定期的扁平疣可能會常年存在，所以建議有扁平疣的患者應及時到醫院進行相應的治療，如冷凍、激光，都可以有效地祛除身體表面的扁平疣。
扁平疣是由於病毒引起的，治療目的就是要抗病毒，增強機體的免疫力，患者可以用抗病毒藥物。但是民間有種方法是用白醋治療，可以起到一種腐蝕剝脫的作用。如果是食用的白醋，塗抹反應不是很大。因為在民間經常有人用白醋精塗抹，塗抹以後造成局部的紅、腫、結痂或者脫 落，相當於臨床上用的冷凍或激光治療，都起到角化剝脫的作用。但是食用白醋直接塗作用可能略微要弱，這類患者最好不要輕易在面部試，因為有些人用的不好，會產生局部的刺激，或者留有色沉、黑印。建議患者到正規醫院用藥物治療，這樣更合適。
中醫治療扁平疣以活血、疏肝、清熱為主，代表方治疣湯、馬齒莧合劑、治瘊湯為主，外用藥可以用維A痠軟膏以糾正HPV感染的角質形成細胞異常角化，促進機體建立特異性細胞免疫反應，清除病毒，也可用干擾素氟尿嘧啶軟膏、0.7%的斑蝥素治療，也可採用冷凍、電灼、激光等物理治療，現在臨床上主要以干擾 素軟膏和維A痠軟膏交替使用，因為干擾素有提高免疫功能的作用，維A痠軟膏有剝脫的作用，二者合用效果甚佳，還有中醫中藥如斑蝥毒素，可以去醫院讓大夫敷塗以防感染。
中藥治療扁平疣效果很好，扁平疣分風熱毒結和痰瘀互結兩型。風熱毒結皮疹較多，顏色淡紅或皮膚顏色自覺瘙癢有同形反應，即急性扁平疣，治療上可用馬齒莧合劑加木賊草、夏枯草、牡蠣等口服、外敷，毒瘀互結型扁平疣皮疹多硬、顏色暗淡、不痛不癢。
扁平疣也屬於疣的一種，是病毒性的感染，可以治療，但是不能根治。既然是病毒性的感染，說明有病毒接觸人體，種植在皮膚表面，並且患者身體的免疫力不夠，不能夠監控病毒，不能夠去除病毒，兩個條件合在一起才會得病，也就是條件致病。可以通過兩個手段治療，殺滅扁平疣的病毒或清除扁平疣，還有提高身體的免疫力，通過提高免疫力間接殺滅病毒。因為是條件致病所以不能根治，某一階段免疫力下降後又接觸病毒，兩個條件合在一起還會復發，所以根治是做不到的，但是可以想辦法把患者的扁平疣清除之後，通過對患者的身體的調理，或藥物調理，或通過自身的鍛鍊，讓患者的免疫力比較長時間的維持在高峰值。就是中醫所謂的正氣存內，邪不可幹，即使再遇見扁平疣病毒接觸到皮膚表面，也不會再發病。
扁平疣是人類乳頭瘤病毒（HPV）感染傳播引起的皮膚棕黃色、棕黑色的扁平光亮的小丘疹。治療最推薦的辦法是冷凍治療，必要時也可以進行激光、電灼治療。如果個數非常多、範圍非常廣、部位比較關鍵，也可以外用維A酸類或者咪喹莫特殺病毒、抑制病毒的外用藥物進行治療。如果患者反覆感染，則 說明患者的抵抗力比較低，同時還要使用增加免疫力，增加抵抗力的藥物，比如玉屏風等，同時也可以口服維甲酸類藥物進行治療。
扁平疣是人乳頭瘤病毒感染所致，主要是通過直接接觸傳染所致，但是通過間接比如物品也可以傳染。直接傳染不是握手就能傳上，必須是扁平疣皮損的地方破潰，把病毒釋放出來；同時受傷的地方皮損或者細胞受傷把病毒接種進去；同時人的抵抗力又不足以抵抗病毒，才能使人乳頭瘤病毒在局部得以繁殖生存。經過進一步的搔抓和摩擦以後，可以傳到其它部位，如此進行自身的傳播。間接傳播可以通過物品以及微損傷等進行傳染。對於患者本人來說，局部皮損可以進行冷凍、微波或者抹藥、吃藥進行治療。但是治了以後不代表終身對扁平疣有抵抗力，一旦接觸以後還會再患，類似於感冒，只要有感冒病毒，在抵抗力足夠低的時候還會復發。所以這個病不會永遠消除，大多數人終生都會得一次。
扁平疣是由人乳頭狀瘤病毒即HPV感染引起的，好發於青少年的病毒感染性疾病。臨床表現為皮色或粉紅色扁平丘疹，多見於面部和手背，無明顯自覺症狀，病程慢性，可通過直接或間接的接觸傳染。