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腦垂體腺體在蝶鞍上面，如果自身免疫原因、炎症原因破壞垂體，會出現萎縮。還有這個情況，比如垂體周邊有顱咽管瘤，如果增大到一定的程度，也會壓迫垂體，導致垂體萎縮。還有蛛網膜出現問題，堵塞以後，腦脊液壓迫垂體也會出現空泡蝶鞍，垂體被壓扁、壓萎縮。由於疾病的 原因、自身免疫原因受到破壞以後，出現萎縮，繼而功能出現異常、功能低下，這樣也會出現臨床上垂體激素分泌不足的相應表現。甲狀腺功能出現減退、腎上腺皮質功能減退以及性腺功能的異常表現。根據病人具體情況，如果壓迫引起的就要針對壓迫腫瘤、佔位病變進行處理，手術切除、放射治療。在這個基礎上判斷，測定激素水平，給予適當激素補充治療。
垂體可以分泌泌乳素，在遺傳因素下，如果垂體自身缺陷可以導致泌乳素分泌的異常。泌乳素瘤的發生，細胞單克隆的增生，使泌乳素的水平升高。藥物比如避孕藥也可以使體內泌乳素水平升高，泌乳素水平升高會引起機體異常症狀。如果出現泌乳、月經紊亂 甚至閉經，部分男性有乳房發育或者性腺功能下降，體檢中發現泌乳素水平的異常，都應該儘早治療。
垂體性侏儒症由於垂體分泌生長激素不足，或者機體對於生長激素抵抗導致生長激素缺乏狀態。治療要補充生長激素，一般及時補充、合理用藥可以使部分病人身高得到追加，得到增長，根據身高體重計算每日用藥量。通常採用25-50μg/(kg·d)的劑量，在睡前皮下注射，更好刺激機體身高生長。但是生長激素使用也有很多的問題，合理使用，避免藥物不良反應。由於生長激素可以促進細胞有絲分裂，所以白血病或者腫瘤概率增加的可能性。在啟用藥物之前，一定要充分評估病人狀況、缺乏程度、身高動態增長速度以及相應基礎疾病的情況，才能夠做到合理安全的使用藥物。
垂體功能低下的治療方法如下：1、對症治療。對症治療是補充缺少的激素，如果檢查垂體功能低下，檢測是哪部分功能低下，前葉還是後葉；生長激素缺乏、促甲狀腺激素缺乏、促腎上腺皮質激素缺乏，還是促性腺激素缺乏。依據不同的指標補充不同激素就叫對症治療。補充以後，再依據補充 後激素水平的變化，根據情況調整藥物的劑量；2、病因治療，如果由於自身免疫損害，急性期時可以考慮免疫治療，比如激素或者免疫抑制劑治療。如果腫瘤因素引起，針對腫瘤進行放射治療或者手術治療，使腫瘤起始因素去除以後，這部分病人都有可能使垂體功能低下有所改善。是否能夠治癒，還要結合病因、對症治療以後激素水平評估；3、基因治療，通過腺病毒載體導入到垂體激素啟動子上，達到轉基因表達的目的，從而進行病因治療。
垂體有非常多的內分泌功能，包括下丘腦-垂體-甲狀腺、下丘腦-垂體-腎上腺、下丘腦-垂體-性腺，這是有完整的靶腺的三個腺體。除此之外，還分泌泌乳素、生長激素等激素，當這些激素分泌不足的時候，臨床當中就會表現為甲狀腺功能減退、腎上腺皮質功能減退、 性腺功能減退。
垂體分泌有非常多的激素，這種激素對人體的生長發育有著非常重要的作用。垂體主要分泌影響支配甲狀腺的促甲狀腺激素，影響到腎上腺皮質的促腎上腺皮質激素，管理性腺的促性腺激素，其分兩個，一個是促卵泡生成素以及促黃體生成素，再有生長激素和泌乳素。
垂體分泌的叫生長激素，它與身高有非常密切的關係。在青春期發育之前以及新生兒期，生長激素都有大量的分泌，有一個分泌高峰，對身高有作用。補充生長激素是能夠影響身高的，或者生長激素和身高有密切關係，但是沒有辦法刺激腦垂體。
垂體前葉功能減退主要是因為垂體病變造成的相應激素分泌減少的症狀，腫瘤、缺血性壞死、炎症以及下丘腦疾病，均會造成垂體功能減退。垂體功能減退可以表現為單一激素減少，也可以表現為多種激素減少。比如席漢氏綜合徵，是因為產婦產後大出血，導致垂體缺血性壞死而造成功能減退。表現為促性腺激素減少，使得外周性腺器官功能減退，女性會出現閉經、無泌乳、性器官萎縮、毛髮脫落；男性會表現為性慾減退、肌肉鬆弛以及骨質疏鬆等。如果病變影響到甲狀腺軸，表現為促甲狀腺激素分泌減少，甲狀腺是靶器官，會引起甲狀腺功能減退，引起一系列症狀，如代謝低下、興奮性減低等；如果影響到腎上腺，會引起腎上腺皮質功能減退的症狀。
垂體功能減退的治療一般分為病因治療、替代治療。病因治療就是針對垂體發生的病變，比如垂體腫瘤造成的病變，首選手術、化療、放療等治療。如果是席漢氏綜合徵，也就是垂體產後大出血引起的垂體功能減退，要加強預防，加強產婦的教育，加 強對生產過程中的積極防範措施，減少垂體席漢氏綜合徵的發生。替代治療就是根據功能減退的程度和影響靶器官的程度，做相應替代治療。如果發生甲狀腺功能減退，會用甲狀腺激素替代；如果出現腎上腺功能減退，會用腎上腺糖皮質激素進行替代，替代治療要維持終身。