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系統性紅斑狼瘡的發病機制尚不明確。臨床認為發病與遺傳因素、環境因素、雌激素水平有關，其病機為各種因素相互作用，導致T淋巴細胞減少、T抑制細胞功能降低、B細胞過度增生，進而產生大量自身抗體，與患者體內相應的抗原結合形成免疫復 合物，沉積在皮膚、關節、小血管、腎小球等部位，在補體的參與下引起急慢性炎症、組織壞死，如狼瘡腎炎，抗體直接與組織細胞抗原作用引起細胞破壞。紅細胞、淋巴細胞、血小板的特性抗原與相應自身抗體結合，引起溶血性貧血、淋巴細胞減少、血小板減少症，最終可導致機體多系統損害。
系統性紅斑狼瘡的發病率隨著診斷水平提高、生活水平提高、生活環境改變，呈逐年上升趨勢。但確診系統性紅斑狼瘡後並不需要過於擔憂，應積極配合治療，經長期規範化治療，可以較好的控制病情進展。若不積極治療，可發展為重型系統性紅斑狼瘡，易導致全身多臟器嚴重損害，且病情進展非 常迅速，發病幾個月便可進入嚴重狀態，甚至危及生命。
紅斑狼瘡很厲害，影響器官很多，尤其是重要器官，比如心臟、腎臟，神經系統，肺臟，都非常重要，甚至可以導致死亡。紅斑狼瘡治療分兩個方面，疾病本身的治療，即風溼病的治療。風溼病的治療，只有兩大類藥，激素和免疫抑制劑，紅斑狼瘡這兩個藥都得要用，激素肯定必不可少，是治療紅 斑狼瘡的基礎用藥。還有一種藥叫羥氯喹，這個藥在國際上也是治療紅斑狼瘡的基礎用藥，程度輕一點，可能這兩個藥就夠，但是重一點絕對需要免疫抑制劑，比如環磷酰胺，嗎替麥考酚酯等，除了這類藥以外，其它對症治療藥，比如發燒等，還有病因，比如伴有感染，可能會用抗生素，或者皮膚的病變，可以用皮膚用藥等，除了主線治療以外，其它輔助治療與所受累器官有關係。
紅斑狼瘡作為自身免疫紊亂所導致的疾病，可以累及全身幾乎各器官、系統，主要治療依賴於藥物。治療紅斑狼瘡的藥物裡最重要的是糖皮質激素，老百姓平常講的激素。激素多是紅斑狼瘡患者，尤其是有一定 表現的中重度狼瘡患者第一個選用的藥物。一旦起始用藥以後，多數患者需要長期服用，但是到底需要服用多久，是不是需要終身服用存在個體差異。有的患者隨著治療過程病情可以好轉，還會聯合使用羥氯喹或免疫抑制劑。所以後續治療過程中，激素有可能減停，用免疫抑制劑或羥氯喹維持即可。但是激素治療紅斑狼瘡的過程中一定需要長期用藥，若有能夠減停的機會是最好了，一部分患者疾病會復發，有可能需要終身服藥。
系統性紅斑狼瘡，是一種自身免疫系統疾病。60年前該病死亡率較高，隨著科學技術與醫學的發展，通過激素、抗炎藥、免疫抑制劑等藥物治療，能有效控制狼瘡活動，減少臟器損害，依從性高的患者，病情能得到有效控制，生存率相對較高，可達到30年以上。系統性紅斑狼瘡需長期服藥，在病情控制後，需在醫生指導下，逐漸減量，適當時機可考慮停藥。
系統性紅斑狼瘡這個疾病，有些人會出皮疹，特別是對於陽光的照射特別敏感，曬太陽之後，皮疹會加重，大概40%的病人會出現這種情況。如果是有皮疹的病人，就儘量減少陽光、紫外線的照射，所以出門的時候，有太陽的天氣，要帶遮陽傘 或者穿長袖的衣服；或者戶外如果有曬太陽，要用一些防曬霜減少紫外線的照射；另外，臉部有皮疹的病人，儘量洗臉的時候用溫水來洗，不要用一些比較劣質的化妝品，比如用肥皂洗臉，也是對皮膚不利的。
系統性紅斑狼瘡是一種自身免疫性疾病，是由於抗原和抗體介導結合後產生補體，使得免疫系統發生免疫紊亂所導致的疾病，是因為自身免疫紊亂所導致的身體各器官系統異常，在血裡能夠查到很多自身抗體。 自身免疫發生紊亂其實有誘因存在，如有時是因為紫外線暴曬、病毒感染等因素導致了發病，甚至在遺傳基因背景基礎上存在誘因時，自身免疫發生紊亂。
系統性紅斑狼瘡是全身多臟器受累的自身免疫性疾病，臨床表現可以多種多樣，可以出現皮疹、脫髮、口腔潰瘍、胸腔積液、間質性肺炎、蛋白尿、血尿、關節炎等，所以如果有關節炎的情況下，患者會有關節腫脹、關節疼痛情況。患者可有口腔潰瘍，一般的紅斑狼瘡的口腔潰瘍是一種無痛 性的口腔潰瘍，但是如果合併感染，該類潰瘍表現疼痛明顯。如果肺部受累可能會有胸腔積液，少量的胸腔積液在呼吸時，也可以引起呼吸時胸疼。系統性紅斑狼瘡本身的病變基礎為血管炎，全身都可以受到累及，如果累及到胃腸道，可以引起胃腸道消化道出血或者胃痛、牽涉痛等情況。所以系統性紅斑狼瘡可以引起疼痛，具體是何種部位疼或者疼痛的方式，需要觀察受累的臟器和部位決定。
補體C3是補體系統中常見的臨床檢測成分，參與機體免疫反應以及針對外來病原菌的免疫反應。臨床觀察補體C3下降見於多種原因，如結締組織病、系統性紅斑狼瘡，在疾病活動期可出現補體C3下降，疾病控制後C3逐漸恢復。
補體C3和C4屬於補體一種成分，發現降低時通常由於疾病或其他原因導致。首先需要明確疾病或原因，臨床常見系統性紅斑狼瘡，在疾病活動期出現補體C3、C4下降，為系統性紅斑狼瘡疾病活動指標。因此，指標下降需尋找背後潛藏疾病是否處在活動期。
抗dsDNA抗體指抗雙鏈DNA抗體，抗體最常見於系統性紅斑狼瘡患者，通常與系統性紅斑狼瘡疾病活動相關。若系統性紅斑狼瘡患者血中出現抗雙鏈DNA抗體陽性，同時出現補體降低，需注意患者可能發生狼瘡腎炎。
自身免疫病患者體內出現較多針對自身物質的抗體，DNA屬於體內遺傳物質。系統性紅斑狼瘡患者體內免疫平衡打破後，出現自身免疫現象。針對自身遺傳物質會產生多種自身抗體，部分針對於雙鏈DNA的抗體稱為抗雙鏈DNA抗體。
抗雙鏈DNA水平較高時，常為疾病活動期。需注意評估患者疾病活動，給予相應治療。已經治療過程中的患者，尤其對於已經穩定患者，如果複查過程中發現抗雙鏈DNA增高，需要考慮患者是否存在疾病復發，需要進一步進行更多檢測證實。