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根據肝囊腫的病因，可以適當選擇中成藥，比如桂枝茯苓散、六味地黃丸、補中益氣丸。這些藥物的選擇應根據個體情況、根據四診合參，來辨證施治。不能一味選用哪種藥物或者能保證療效，一定要個體化治療。中藥可以緩解症狀，但是肝囊腫治療一定要根據個體的情況。如果是大的肝囊腫最好要採用手術或者其它辦法來治療，才能達到滿意療效。
肝囊腫是常見的肝臟疾病，艾灸肝臟無顯著效果。肝囊腫較小可以不予處理，較大或伴明顯症狀者，可以行手術治療。肝右葉囊腫>10cm，肝左葉囊腫>5cm或肝右葉囊腫8-10cm，靠近邊緣，應手術治療。目前手術治療方案有以下兩種。
肝囊腫患者吃護肝片沒有任何效果，肝囊腫是一種良性病變，主要是由於肝臟細胞分泌異常導致的囊性包裹，吃藥物沒有任何效果。臨床上如果肝囊腫小於5cm，沒有臨床症狀或者肝功能影響，可以定期做常規體檢，動態觀察肝囊腫是否有增大的趨勢。
體檢發現肝囊腫，明確診斷之後患者可以定期予以複查，如果囊腫的最大直徑＜5cm，可以考慮繼續予以觀察，如果肝囊腫的最大直徑＞5cm，需要根據囊腫的部位，進行超聲引導下的穿刺引流，或者在腹腔鏡下進行囊腫的去頂引流。在手術治療之後，還要及時複查血常規、肝功能。
肝囊腫消失在臨床上一般很少發生，肝囊腫是肝臟常見的病變，大多數情況下，是由於膽管、淋巴管發育異常所導致，可能和炎症、感染等因素有關，肝囊腫消失主要是見於肝囊腫較小、細胞增生、囊壁萎縮，具體如下：
很多人體檢發現多發肝囊腫，然後就誤認為自己得了“多囊肝”，那“多發肝囊腫”和“多囊肝”是一種疾病嘛？ 不，“多發肝囊腫”和“多囊肝”是兩種完全不同的疾病。 多囊肝 多囊肝是一種常染色體顯性遺傳病（家裡有遺傳史），常表現為肝臟的多發性瀰漫損害。多伴有多囊腎，有時可伴有胰腺、脾臟、肺、卵巢等囊性病變。 診斷：依靠DNA分析（人第16對常染色體異變）。治療：小的、無症狀的不需要處理；大的、影響肝功能的手術治療。 多發肝囊腫 多發肝囊腫實質上還是“肝囊腫”。肝囊腫說簡單一點就是一個個小水泡，一般來說不超過5-8公分不需要處理。藥物治療無效（所以沒必要吃藥！！！）。超過5-8公分的肝囊腫多采用超聲引導下肝囊腫穿刺抽液+無水酒精注射術或者腹腔鏡肝囊腫開窗減壓術。 超聲引導下肝囊腫穿刺抽液+無水酒精注射術：優點：局麻下進行，無需全麻。 缺點：可能反覆 發作，等抽液穿刺孔癒合後內部可能繼續產生液體。 腹腔鏡肝囊腫開窗減壓術：優點：在肝囊腫頂部開個窗，即使產生新的液體，也可以自己流出來。 缺點：全麻手術。 多囊肝與多發肝囊腫的鑑別要點： 多囊肝多半是先天性的，常伴有多囊腎；而多發性肝囊腫多半是後天的。
肝囊腫屬於臨床比較常見的肝部良性疾病，可分為單純性肝囊腫、多囊性肝病，以及肝包蟲囊腫。肝囊腫患者囊腫增大到一定程度，壓迫臨近臟器可誘發患者出現食後飽脹感、噁心、嘔吐以及右上腹隱痛等不適症狀。一般可通過腹部超聲、CT等檢查明確診斷。治療方法根據不同類型各有差異：