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腦脊液的化驗通常需通過腰穿進行，需要住院的患者進行腰穿和腦脊液的化驗。腦積液的化驗和腰穿檢查的收費，在不同的地區、不同的醫院可能收費不一樣，基本腰穿費約幾百元，化驗費主要根據化驗的項目決定。若患者只是做常規、普通腦脊液的常規和生化檢查，費用不會很高，若需要進行腦脊液的培養費用會更高。
腦脊液檢驗主要包括理學、化學有形成分及病原學檢查。中樞神經系統任何部位發生感染、腫瘤、外傷等均引起腦脊液性狀和成分改變，從而為中樞神經系統疾病的診斷和治療提供依據。腦脊液主要由臨床醫師採集，一般行腰椎穿刺，必要時從小腦延髓池或側腦室穿刺採集，將腦脊液分別收集於3個無菌試管中，每管1-2ml。第1管做化學或免疫學檢查，第2管做病原學微生物檢查，第3管做理學和顯微鏡檢查。標本採集後無特殊處理要求，應立即送檢，不超過1小時，因為久置可以導致細胞破壞，影響細胞計數及分類檢查，葡萄糖分解使含量降低，以及病原菌破壞或溶解。病原微生物檢驗標本需室溫條件下運送，以免冷藏致某些微生物死亡。細胞計數管應避免標本凝固，遇高蛋白標本時可用EDTA鹽抗凝。