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一側嚴重重複腎積水時，需要行類似於半側重複腎積水腎的切除，同時切除一半輸尿管。腎盂、腎盞，切除以後需進行縫合。如縫合的位置癒合快，不會出現漏尿、滲液的情況。患兒腹腔引流管的引流液是周圍切口附近的滲液。如果滲液 逐漸減少，少於50mL時可拔除引流管。如患兒腎盂、腎盞手術以後縫線脫落，每天產生超過100-200mL清亮的液體，就要懷疑患者出現尿瘻的可能性。引流液可做尿肌酐比值的測定，如果測定結果確定是尿液的滲出，則不能拔除引流管，但如果引流液逐漸減少，連續兩天少於50mL，可以拔除引流管。
重複腎手術前常見症狀為反覆泌尿系感染，手術後同樣可能出現感染現象。如嬰幼兒存在反覆泌尿系感染，一般認為存在再次感染可能性。因嬰幼兒抵抗力低下、身體自愈能力較差，對外界病菌抵抗能力較差，所以泌尿系感染不易痊癒，且易出現反覆感染現象。
輸尿管畸形有很多種。常根據不同的畸形的類型，來做出相應的治療、處理。數目方面的畸形，輸尿管的閉鎖，還有雙輸尿管，就是一側有雙輸尿管，往往還併發重複輸尿管、重複腎，在臨床當中比較常見。還有一側有三四重輸尿管畸形，就是3根或4根輸尿管。還有有倒Y型的輸尿管， 靠腎臟這一側，是1根，靠近膀胱這一側是2根。還有從結構上，有輸尿管發育不全，或者輸尿管遠端的閉鎖，遠端閉鎖以後，近端就形成巨大的膨脹。還有巨輸尿管，輸尿管從上到下都是擴張，還有輸尿管的末端的異常畸形、異位的開口，輸尿管正常，都是開口在膀胱，輸尿管開口在外生殖器的會陰部。會經常尿溼褲子，還有輸尿管位置的改變，位置的畸形，在腔靜脈後面或者髂動脈後面，要根據不同的畸形做出不同的處理。
重複腎手術目前治療趨勢主要為微創手術，治療成功率達95%以上。主要以重腎切除、重腎輸尿管吻合及輸尿管再植為主。隨科技進步，機器人重腎手術微創治療可提高成功率，具體如下：
如果兒童存在重複腎，目前臨床上還沒有發現多餘的腎臟可以自己吸收。但是如果兒童重複腎合併有腎積水，即腎積水型重複腎，屬於重複腎其中的一個類型，積水的程度有輕有重。
正常患者重複腎術區，腎周放置引流管屬於常規操作，也是必要操作，主要是觀察有沒有尿液或者血性液體引流，術後有少量尿液或者少量血性滲液引流出來屬於術後正常現象。如果尿液引流較多，一天幾百毫升尿液引出，說明手術中可能傷到下腎腎盂或者上腎腎盂， 分泌尿液過多導致。上腎供應血管沒有完全結紮，也是上腎尿量增多表現。尿量多時可能每天100ml左右，甚至更多。如果沒有出現損傷腎盂等情況，隨著時間推移，引流量會逐漸減少，少於10ml以下時可以拔除引流管。
重複腎有不完全性重複輸尿管畸形或者完全性重複輸尿管畸形，如果輸尿管均開口於膀胱，而且沒有合併症，病人通常沒有臨床症狀，只有進行B超或者泌尿系全面檢查時偶然間發現，此類病人佔60%以上，多無需治療，也不需要特殊處理。重複腎有合併症，出現腎盂腎炎、腎結石、結核、腫瘤、腎積水等情況，有上述症狀以後，進行泌尿系檢查時發現，上述病人需要進行手術治療。
兒童重複腎的腎積水，大部分手術方式是重複腎輸尿管切除，切除掉半個腎之後，剩下半個腎基本上保持原狀，可能會隨著小孩的長大而長大，但是，不能長到和對側腎一樣大，一般情況下沒有特殊後遺症，對生活沒有太大影響，發 生尿路感染的可能性比正常腎要大一些。