膽固醇偏低的原因主要是以下幾種：有一些疾病會導致膽固醇水平偏低，比如惡性貧血、溶血性貧血、甲狀腺功能亢進症的時候。血清膽固醇會比較低，一方面和消耗過多有關，一方面和攝入不足有關。有些藥物會減低膽固醇水平，如氨基水楊酸、卡那黴素、肝素、維生素C等。在嚴重感染、營養不良等情況下，膽固醇也會偏低。再有就是敗血症、嚴重感染、肝病、肺結核等消耗性疾病時，都會出現低膽固醇血癥。