小兒腦積水在明確診斷並進行積極治療後，大多數愈後較為良好。關鍵在於能夠明確患兒的病因，積極去除病因，那麼在治療上就會比較順利。比如是腫瘤引起的腦積水，在切除腫瘤後，就可以治療腦積水。先天性腦積水的患兒可以通過分流術等手術方法治療，細菌性腦膜炎等感染原因引起的腦積水，可通過足量、全程的應用適合的抗生素控制感染，腦積水也會逐漸恢復。