紫紺型先天性心臟病根據不同的疾病種類，預後並不相同。但是總體而言，這類疾病的預後都是不好的，尤其是一出生就有的紫紺性的先天性心臟病，大多需要儘快手術治療。如果不進行手術，可能很快會死亡。比如先天性的肺動脈瓣閉鎖就是一種非常嚴重的一出生就發紺的先天性心臟病，這種疾病在出生24小時之內就要做手術。最常見的紫紺性的先天性心臟病是法洛氏四聯徵，根據右室流出道狹窄程度的輕重，法洛氏四聯症的手術時間會有所不同，但是大多數都需要在一歲以內或者一歲左右做手術。做了手術之後，很多紫紺型先天性心臟病預後也會很不錯，一般都可以正常生活、工作、結婚、生子，壽命與正常人差不多。