紫紺型先天性心臟病的治療，需要根據具體的疾病類型才能來決定。如果是法洛氏四聯症，肺動脈狹窄，肺動脈瓣閉鎖這樣的從一出生就表現出紫紺的先心病，就需要儘快手術治療，尤其像肺動脈閉鎖這種嚴重的紫紺型先心病，很多需要出生24小時內就做手術。而法洛氏四聯症根據右室流出道狹窄的程度，手術時間會不一樣，但大多數需要在一歲左右就做手術。如果是房間隔缺損，室間隔缺損，動脈導管未閉這些剛開始並沒有紫紺的簡單性先心病，隨著病程進展出現了紫紺，那很可能肺動脈壓力已經非常高，甚至出現了艾森曼格綜合徵，後者的話就已經失去手術指證了，只能應用降肺動脈壓的藥物做對症治療，但由於心臟的結構缺損持續存在，降肺動脈壓力治療的效果並不好。到了這個階段，唯一的辦法就是做心臟和肺的聯合移植了。