胎兒先天畸形一般五個月可以查出來，胎兒畸形檢查目前主要是通過B超或彩超，在懷孕20~24周內胎兒的各個臟器都已能通過B超清楚地顯現出來時可以檢查出來。兩個多月就可以檢查出胎兒是否有胎心、胎芽，五個月的時候就可以看出是否畸形，但是有時候胎兒畸形也都到8-9月才可以查出來的。如果B超發現此時胎兒腦脊膜膨脹、突出，無腦、脊柱裂、腦積水、多腎，或明顯地內臟外翻就應及時流產，以免拖至妊娠晚期給孕婦造成更大的痛苦。