新生兒膈疝即嬰兒期發生的膈疝，通常發生在橫膈後外側的胸腹裂孔疝，以及食管裂孔疝。食管裂孔疝是由於食管的正常裂孔鬆弛，使腹腔器官進入到胸腔或後縱隔部位而造成。食管裂孔疝主要表現是消化道症狀。一般採用手術方法治療。另外還有極個別的疝會發生嵌頓，嵌頓是疝內容物受到卡壓導致器官缺血壞死，從而引起嚴重併發症，需要及時治療。