煙霧病搭橋手術本身的後遺症的發生幾率，相對來說是比較低的，和其他的開顱手術的後遺症大致是相同的，只不過是搭橋術後有的病人因為再灌注有再出血的可能。但是臨床當中，在手術之後要通過嚴密的控制病人的血壓，這種併發症相對來說發生的幾率比較低。對於其他的併發症就像和普通的開顱手術一樣，因此也沒有太多的相對於搭橋手術本身的併發症。另外，也有一部分病人因為在煙霧病的搭橋手術，特別是手術當中，如果血壓過低，也可能造成搭橋手術對側的大腦會出現缺血性的改變。這是手術當中應該儘量預防，在手術當中也和麻醉儘量的合作，把病人的血壓不要降得太低，儘量保持病人腦氧的正常和血壓的正常。