臨床上胸腺瘤通過Masaoka分期，Masaoka分期是根據患者有無腫瘤包膜侵犯、遠處轉移，分為Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期和Ⅳ期，不同分期的復發概率、5年生存率完全不同。具體如下：

1、Ⅰ期胸腺瘤，5年生存率在94%-100%，這類患者預後好；

2、Ⅱ期胸腺瘤，5年生存率在80%-95%；

3、Ⅲ期胸腺瘤治療效果差，5年生存率只有56%-69%；

4、Ⅳ期胸腺瘤預後差，5年生存率只有11%-50%。胸腺瘤復發與否，關鍵因素在於腫瘤有沒有包膜，有完整性包膜的胸腺瘤與周圍臟器沒有粘連，只要單純外科手術切除，85%-90%的患者都可以治癒，術後復發概率低。侵犯周圍軟組織肺，或者大血管侵犯、心包侵犯，患者術後沒有給予輔助放化療，術後容易復發，小的胸腺瘤包膜完整也有復發風險。完整切除後的胸腺瘤，復發概率在10%-30%，復發時間從術後數年到數十年不等，平均復發時間為5年。患者術後輔助放化療可以減少復發概率，研究推薦有復發的患者可以再次手術。再次手術治療複發性胸腺瘤，少數患者預後可以取得較好療效。且放化療、靶向治療、免疫治療，也可以作為胸腺瘤復發以後的一種治療手段。