根據WHO世界衛生組織病理分型，現在將胸腺瘤分為A型、AB型、B型和C型，但是每個分型又有不同的良惡性傾向。

通常認為A型和AB型傾向於良性，B型根據細胞成分的不同，又細分為B1、B2、B3不同的亞型，B型裡就有可能具有惡性的傾向，C型就是通常所說的胸腺癌。通常認為C型胸腺瘤是惡性腫瘤。根據最新分型，還有一部分胸腺的神經內分泌瘤也將歸為胸腺瘤。