胸腺瘤的預後與它的分期有關。A型胸腺瘤經手術切除乾淨後，一般複發率較低，預後較好；AB型或B型胸腺瘤，已不是單純的良性腫瘤，常處於良惡性的交界，或已經有惡性的情況，患者手術之後還需做進一步的放療和化療，預後較好，多數患者均可活到五年以上；C型的胸腺瘤比較傾向於癌，預後差，會出現惡病質改變，發生胸腺瘤的併發症，如重症肌無力等。