胸腺瘤一經確診，建議以手術切除為主。若發現胸腺瘤而不予治療，隨時間發展，胸腺瘤體積將增加，並且侵犯周圍器官及組織。對於單純胸腺瘤，手術切除可達到治癒目的，但部分患者隨著腫瘤體積增加，可外侵其他組織或發生遠處轉移，單純手術治療效果不佳。對於無法根治性切除的患者，可選擇術後放療。目前胸腔鏡微創手術切除是常採用的一種方式，手術創傷較小，術後恢復較快，對於胸腺瘤包膜完整，無明顯外侵的患者，手術效果較好，但對於發生外侵或轉移的患者，手術效果不佳。