臨床上治療焦慮強迫症主要採用藥物治療、心理治療的方案。藥物治療在臨床上具有一線治療作用的，如帕羅西汀、舍曲林、氟伏沙明、氟西汀等藥物。在治療過程中要全病程系統規範的治療，

在心理治療過程中，主要針對患者進行認知行為治療，包括對於強迫症患者的症狀以及應對方案進行系統規範的認知心理教育。告訴患者引發其強迫的行為主要是強迫思想導致的，而焦慮也是強迫思想導致的。所以在治療過程中，要根據焦慮程度從小到大排列症狀清單，幫助患者暴露的強迫行為和強迫思維之下，通過暴露反應預防的治療方法來幫助患者學會忍耐焦慮體驗，通過減少強迫行為，消除強迫行為，進行強迫症的系統規範的治療可以取得良好的治療效果。在此期間要給予患者支持性心理治療，幫助患者樹立治療的信心和決心，可以取得更加良好的治療效果。