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鼻塞是一個臨床常見症狀，它並不是鼻咽癌確診的診斷依據。導致鼻塞的原因較多，鼻咽癌只佔鼻塞病因的一小部分。鼻塞常見的病因包括鼻中隔彎曲、鼻腔炎症等，因此鼻咽癌只是引起鼻塞的一個比較少見的原因。
鼻咽部異物感引起原因較多，不是鼻咽部存在異物感一定屬於鼻咽癌。引起鼻咽部異物感原因最常見良性病變較多，例如慢性咽炎或慢性扁桃體炎、鼻竇炎等慢性炎症，可以刺激咽部引起鼻咽部異物感。過敏性疾病，即過敏性鼻炎會累及到鼻咽部黏膜，引起咽部異物感或咽部發癢，以及患者存在刺激性咳嗽情況。
耳部疼痛不一定是鼻咽癌，引起耳部疼痛原因較多，由於慢性中耳炎或咽鼓管病變，可以導致耳部疼痛，耳部附近結構炎症例如乳突炎或腮腺炎等特殊炎症也可以波及耳部可以引起疼痛。耳部疼痛屬於鼻咽癌常見症狀，可以引起耳部疼痛原因主要是腫瘤壓迫咽鼓管以後導致咽鼓管不通暢，分泌物引流不暢以後容易發生感染會引起耳部疼痛。
鼻出血和痰中帶血屬於鼻咽癌常見症狀，但不能認為鼻出血和痰中帶血一定屬於鼻咽癌。引起鼻腔出血原因較多，大部分原因為鼻部良性病變，例如慢性鼻炎、鼻竇炎，由於慢性炎症刺激，導致局部血管炎症，血管擴張或破裂，可以引起鼻出血或痰中帶血。
部分患者認為鼻腔內出現黃鼻涕、有分泌物即為鼻咽癌，這種情況距離鼻咽腫瘤的診斷相差較遠。確實有一部分鼻咽癌患者會出現鼻咽部有大量濃稠分泌物，而且這種分泌物有異味，鼻咽癌更典型的表現是在晨起時會出現血性分泌物。如果是黃色黏稠分泌物時，要注意患者是不是有既往上呼吸道感染病史，沒有治療徹底，繼發慢性鼻竇炎症。
鼻咽癌患者的鼻部出血並不是只有晨起時才會出血，但是晨起時容易發現。平臥休息之後，因為解剖位置的原因，出血積聚在鼻竇中，直立起床以後出現體位變化，導致血性鼻腔分泌物流出，所以常見的血性分泌物是在晨起。如果是罹患鼻咽 癌，在一天任何時間都會出現這種症狀。
CT的特點為較簡單、方便、掃描時間短、費用低廉，也可以看到鼻咽腔的佔位情況，從而可以幫助初篩鼻咽癌。但如果想看到鼻咽癌累及範圍，或進行鼻咽癌準確的臨床分期，則需要核磁共振的幫助。因核磁共振有較好的組織分辨率，可以多維顯示鼻咽 腔的佔位情況，在臨床上更依賴於核磁共振確診鼻咽癌，以及作為判斷疾病範圍和臨床分期的重要依據。
較多鼻咽癌患者常見症狀為回吸性血涕，指患者在用力吸鼻子的時候，吐出的痰液中會帶有血絲。主要是因為鼻咽癌為生長在鼻咽腔黏膜表面的腫瘤，表面的血管常常結構不完整，容易有出血附著在腫瘤表面。隨著患者吸鼻子的時候會將鼻咽腔的黏液吸到口腔吐出，表面上會帶有腫瘤表面的血絲。
不僅侷限於鼻咽部，身體任何解剖部位，口腔、消化道、呼吸道等部位腫瘤都分為良性和惡性。鼻咽部腫瘤區分良性或者惡性，首先應進行鼻咽部核磁的無創性檢查。在影像學上，如果鼻咽部腫塊沒有明顯外侵徵象，同時血供不非常豐富，影像學特徵趨向於良性，相反趨向於惡性。