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十二指腸潰瘍癒合期會產生疼痛，腹痛程度相較於急性期即A1、A2期有明顯緩解。十二指腸潰瘍分為三期，即A期、H期、S期，A期為活動期，也稱為急性期，H期為癒合期，S期為疤痕期。
十二指腸潰瘍出血是十二指腸潰瘍比較嚴重的合併症。十二指腸通常在胃部下面，長度大概是十二橫指，而十二指腸潰瘍多發於球部和降部，通常在出血量較小時，因為血順著十二指腸、小腸以及結腸隨著大便流出，患者會出 現黑便。如果出血量較多，比如十二指腸潰瘍面上的小動脈破裂出血，患者可能會出現嘔血。
十二指腸潰瘍Forrest分級是十二指腸出血的評價體系，分為Forrest1級、Forrest2級、Forres3級，其中Forrest1級又分為1a、1b，Forrest2級分為2b、2a、2c，Forrest3級就是單純的3級，區別主要如下：
十二指腸潰瘍S1期意味潰瘍基本較好，即潰瘍面已經癒合90%，離完全癒合只差稍許時間。S是英文單詞即scar疤痕的縮寫，十二指腸潰瘍S1期是十二指腸潰瘍紅色疤痕期，潰瘍面基本癒合，表面均結紅色疤痕，十二指腸潰瘍分期如下：
十二指腸潰瘍患者疼痛的部位主要位於上腹部，劍突下區域，可能偏左或偏右。十二指腸潰瘍痛區域不絕對，呈點狀改變，主要位於劍突下。除了上腹部痛，部分患者還表現為背痛，尤其是十二指腸後壁潰瘍，可以出現慢性穿孔，穿 孔以後腹膜迅速包繞，不會表現為急性腹膜炎症狀，通常表現為比較明顯的背痛症狀，嚴重者可能會出現消化道出血。
十二指腸潰瘍患者出院半個月不要吃香蕉，因為此類人群住院通常是因為存在出血、穿孔或梗阻等併發症。無論是出血、梗阻、穿孔，併發症相對較重，即便是出院，潰瘍病的癒合可能也需要6-8周。
通常胃與十二指腸潰瘍臨床表現主要區別於疼痛部位以及疼痛時間，胃體表投影位於上腹正中部位，十二指腸位於上腹偏右部位。胃潰瘍主要特點為患者進食後出現上腹正中疼痛症狀，而十二 腸潰瘍主要特點為患者飢餓或者夜間睡眠時出現上腹偏右疼痛症狀。
通常十二指腸潰瘍的患者，癌變較為罕見。如果十二指腸潰瘍給予規範診斷、規範治療，通常90%以上的患者可以達到症狀緩解、黏膜癒合，所以通常無需擔心十二指腸潰瘍癌變。由於十二指腸屬於小腸，而小腸環境決定其癌變概率較小。