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女性沙眼衣原體陽性指出現沙眼衣原體感染，沙眼衣原體屬於性傳播疾病，可以通過性生活進行傳播，而且性生活是主要的傳播途徑，除性生活傳播外，其它間接接觸也可能導致傳染，例如公用潔具、毛巾等都有可能導致間接感染。當出現沙眼衣 原體的感染後，多數女性可能沒有明顯症狀，部分女性可能出現膿性分泌物、腹痛，甚至發熱的情況。
沙眼衣原體尿道炎又稱為非淋菌性尿道炎，主要表現分為兩大類，第一類為排尿有刺痛感，第二類為尿道分泌物，分泌物量較少，兩者可同時出現，也可表現為其中一種。非淋菌性尿道炎主要的治療為抗生素治療，臨床上推薦藥物包括左氧氟沙星、 阿奇黴素、多西環素。具體用藥需在醫師指導下進行，同時多飲水，注意休息，避免勞累，暫停性生活。如果患者有性伴侶，要求性伴侶同時進行檢查及治療。
沙眼衣原體是導致沙眼的主要病原微生物，沙眼衣原體檢查陽性提示沙眼存在，此時需要進行治療，是否嚴重主要取決於沙眼對眼表造成的損傷。沙眼在以前屬於常見的眼部疾病，會造成嚴重後果，比如嚴重結膜炎、角膜炎、角膜新生血管，甚至嚴重時會導致眼瞼內翻、瘢痕，甚 至失明。
沙眼衣原體陰性是正常表現，但是沙眼衣原體通常需要多次檢測陰性才能確認正常，有時一次檢測陰性可能會出現誤差或偶然性。沙眼衣原體感染眼部會引起沙眼，同時也容易引起泌尿生殖系統感染，如男性的尿道炎、前列 腺炎、附睪炎，女性的盆腔炎、陰道炎及附件炎等，因此沙眼衣原體如果是陽性，通常應該積極治療。
沙眼衣原體陽性，通常提示體內有衣原體感染。衣原體是一類專性細胞內寄生的原核細胞微生物，沙眼衣原體是臨床上常見的致病性衣原體，流行於世界各地，可通過眼-手-眼的途徑進行傳播，也可通過性接觸傳播。另外，間接接觸被沙眼衣原體汙染的毛巾、洗浴用品也可進行傳播 ，感染沙眼衣原體的孕婦在妊娠和分娩期間還可將衣原體傳播給胎兒或新生兒。沙眼衣原體可導致沙眼、包涵體性結膜炎、性病淋巴肉芽腫以及泌尿生殖道的感染。
沙眼衣原體陽性是否嚴重，取決於患者臨床症狀與沙眼衣原體侵犯的部位。如果單純侵犯眼睛，引起沙眼這種情況不嚴重，多數患者通過對症治療可以自然痊癒，一般可以不應用特殊抗菌藥物治療。
妊娠合併沙眼衣原體感染屬於性接觸傳播的疾病，傳播方式主要是性接觸傳播，也可能通過間接接觸傳播。對於該病的患者，通過做陰道分泌物沙眼衣原體培養加藥敏試驗，根據藥敏試驗結果可選用孕期對胎兒影響最小、效果最好的藥物進行治療。同時可行沙眼衣原體核酸檢查輔助診斷。
沙眼衣原體感染的女性可能會造成盆腔炎性疾病。盆腔炎性疾病如果治療不及時，就比較嚴重，沙眼衣原體造成女性的感染，是處於相對隱匿的過程，感染引起的症狀不是很明顯，有的會引起下腹部的輕微疼痛或者是陰道少量不規則出血，比較隱匿。有的甚至沒有明顯的症狀，就引起盆腔炎症。引起的盆腔炎症多數以輸卵管的炎症多見，主要引起輸卵管不通或者通而不暢的問題。輸卵管不通或者通而不暢就影響懷孕，由於精子、卵子不能見面，或者見了面之後不能正確的運輸到子宮內，甚至導致宮外孕或者不懷孕的情況，後果就比較嚴重。