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肉芽增殖型、淋巴結瘻型、瘢痕狹窄型支氣管結核，可以通過支氣管鏡進行冷凍治療。治療原理是基於智能物質和冷凍器械產生超低溫，可使局部結核性肉芽腫組織以及結核分枝桿菌菌體因組織細胞內水分子迅速結晶成冰。細胞停止分裂溶解壞死，引起局部血流停止及微血栓形成等慢性病理過程造成壞死。
使用支氣管鏡療效較好的支氣管結核患者，用2-3次即可。支氣管結核的治療方法主要包括全身抗結核治療、局部給藥、支氣管鏡介入治療，支氣管鏡介入治療在支氣管結核中的價值已經得到明確證實，治療次數主要與患者病變範圍、病變程度、病變分佈及支氣管腔是否出現狹窄、是否出現閉塞有關。
支氣管結核的複發率與常規結核病類似，只是支氣管結核的治療時間比普通肺結核更長，而且判斷其療效的手段更多。比如支氣管結核決定其停不停藥的情況下，需要複查支氣管鏡檢查，明確看其改變情況、恢復情況，然後再決定治療時間的長短。所以支氣管結核只要規則按照結核病治療，規範治癒之後不容易復發，前提是一定要徹底治癒，複發率就會較低。如果治療時間較短，判斷其療效、手段較粗暴，只是單純拍一張CT就停藥、完成療程，沒有在支氣管鏡下檢測，沒有了解支氣管的情況下就停藥，則其複發率會較高。
支氣管內膜結核在醫學上稱為支氣管結核，其可以治癒。治療方法與普通肺結核一樣，只是其治療的時間長，需要更多判斷其療效的手段。在完成療程之後判斷其能否停藥，不僅要做CT、查痰，還要做支氣管鏡，瞭解支氣管結核恢復情況，然 後才能決定能否停藥。所以支氣管結核與普通肺結核類似，多數都可以治癒，而且治癒之後不容易復發，其療效較好。支氣管結核患者無需過分害怕自己患有肺結核、支氣管結核，實際上這兩種病都是結核病，治療手段類似，只是治療時間的長短、療程長短存在不同。
肺結核大概有10%-40%的人合併支氣管結核，也有少部分原發支氣管結核，是結核菌吸入到體內以後到肺裡面，有些是在支氣管裡面首先繁殖，引起病變叫支氣管結核，如果在肺上引起病變，叫肺結核。
支氣管結核首先是結核病，基本的治療是抗結核治療。抗結核治療以後，如果病變的支氣管部位有潰瘍、壞死等，要進行介入治療，介入治療方法有冷凍、微波等方法。如果後期引起狹窄，可以用球囊擴張，球囊擴張要是不能恢復病人的通氣功能，也可以放支架以保證病人通氣。
支氣管結核治癒跟普通結核差不多，關鍵是跟病情的早晚有關係，一般的療程是一年。抗結核藥物治療目的主要是殺滅結核菌，使病變部位恢復。出現併發症以後通過介入方法，恢復病人的通氣功能，只要堅持治療，療程大概一年，大部分病人都可以 達到治癒的目的。得了支氣管結核以後，首先要對結核病有正確認識，相信這個病能治好，要有信心，配合醫生治療，治療過程中可能會有些曲折，比如出現藥物不良反應，病人精神狀態不好，或者做介入治療有些痛苦，但是隻是暫時的，治好恢復健康，生活還是美好的。