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膽囊手術有腹腔鏡下膽囊切除和開腹膽囊切除兩種，具體如下：1、腔鏡下膽囊切除創傷較小，恢復較快且住院時間較短。為首選方案，而且目前膽囊切除腔鏡手術與開腹效果基本相當；2、如上腹部進行手術，或嚴重急性炎症、粘連較嚴重的患者，建議進行開腹手術；3、如果患者 年紀較大且功能較差，但結石嵌頓較明顯，如果開腹手術感覺粘連較嚴重，膽囊無法徹底切除，也可進行膽囊部分切除。膽囊切開後將結石取乾淨，僅殘餘小膽囊，但部分患者會及時復發或發作膽囊炎、膽瘻。還可使用保膽取石的方法，但不推薦。即打開膽囊將結石取出後，再將切開部位縫合，若患者膽道結石較多或膽囊結石較多，會出現取石不乾淨的風險。術後2年內有40%-50%患者會出現結石復發，還有部分患者保膽取石後會增加膽囊癌風險。
雖然臨床上講究快速康復外科，很多理論認為肝門部膽管癌術後患者需要早期活動、早期下床，但是具體病情還需要具體分析。對於手術範圍特別大的患者，應該以嚴謹安全為第一位，如果為了追求快速恢復，讓患者過早進行大幅度運動，會對患者的手術部 位及腹腔內巨大的手術創面不利。患者在床上也可以適當的活動四肢，比如雙手雙腳在床上伸展，家屬也可以輔助性進行腿部、手部肌肉的按摩，來減少術後深靜脈血栓發生的風險，這樣對於患者的身體也比較安全。
肝門膽管癌是膽道腫瘤，主要位於肝臟左右肝管交匯處。通常手術之前，往往難以取到病理進行確診。術前難取到病理確診，所以手術之前並不需要靠切片確診。術前診斷主要靠症狀，比如病人出現黃疸；靠腫瘤學指標，比如CA199升高，以及CEA、CA15升高，還有靠影像學檢查， 主要是增強CT、增強核磁，所以結合前面這些指標，基本上就可以確診。因為此位置比較特殊，一般手術之前難拿到病理，不像胃或者腸子的癌，可以經過胃鏡或者腸鏡取一塊直接做病理，也不像肝臟實性腫瘤，可以進行穿刺，從中間取到一塊，然後進行病理確診。所以對肝門膽管癌，目前最常用的診斷方法，還是靠病史、臨床表現、腫瘤學指標，以及影像學檢查。
肝門部膽管癌早期治癒率大概在26%，醫學上認為生存時間超過5年為治癒，部分患者5年後可能復發。由於放化療對肝門部膽管癌不敏感，故肝門部膽管癌主要以手術治療為主。肝門部血管豐富，包括肝動脈、門靜脈，癌症生長髮展過程中易侵犯血管，會錯過早期最佳治療時間。肝門膽管癌主要症狀為黃疸，如果出現小便發黃，需要進一步檢查，以排除肝門膽管癌的可能。
肝內膽管細胞癌的惡性程度較高，若不採取干預手段，從早期發展至晚期大概需6-12個月，如果發現較早，進行肝內膽管癌手術後2年生存率大概在50%。目前肝內膽管細胞癌的治療分為化療與靶向免疫，但以化療為 主，可提高生存率。肝內膽管細胞癌的惡性程度比肝細胞性肝癌嚴重，易復發轉移。發病原因可能與肝內膽管結石、肝炎相關，所以出現肝炎或肝內膽管結石的患者，需定期複查B超、腫瘤指標以及肝臟增強CT，以儘早發現腫瘤。
谷氨酰轉肽酶不是腫瘤指標，故無論谷氨酰轉肽酶升到何數值也不代表肝癌。谷氨酰轉肽酶存在於人體多種組織，主要存在於肝細胞內。當肝細胞損傷或膽管梗阻時，谷氨酰轉肽酶都會升高，主要用於鑑別肝細胞有無損傷 、膽管堵塞等，具體如下：1、酗酒可能導致肝細胞損害，出現谷氨酰轉肽酶升高；2、部分肝癌患者會導致膽管阻塞或肝細胞損害，可能引起γ-谷氨酰轉移酶升高。谷氨酰轉肽酶升高並非為肝癌，僅可說明為肝細胞損傷、膽管梗阻或毛細膽管堵塞。
通過肝癌形狀分為結節型肝癌、巨塊型肝癌、瀰漫型肝癌，具體如下：1、結節型肝癌指腫瘤直徑≤5cm，腫瘤個數通常＜5個；2、巨塊型肝癌指腫瘤直徑＞10cm；3、瀰漫型肝癌指左右肝均有大小不等的肝癌結節。瀰漫型肝癌預後最差，結節型肝癌治療效果較好。結節型肝癌分為肝細胞性肝癌和膽管細胞性肝癌，大部分結節型肝癌以肝細胞性為主，結節型肝癌比瀰漫型肝癌5年預後較好。結節型肝癌治療手段包括手術、射頻消融，如果癌結節個數較多，可使用免疫治療與靶向治療。
原發性肝癌手術後不推薦全身化療，具體如下：1、肝細胞肝癌對化療不敏感，多數情況全身化療對肝細胞肝癌無效果，臨床肝細胞肝癌不推薦化療；2、原發性肝癌還包括肝臟膽管細胞癌，對化療敏感性大概在30%，有高危 因素的膽管細胞癌病人推薦使用全身化療。肝細胞性肝癌原則上不推薦全身化療，但有研究表明有化療方案對原發性肝癌有較小作用，但還有更好藥物可通過靶向治療肝細胞肝癌，所以全身化療目前不是首選方案。膽管細胞癌常用方案可為，吉西他濱加順鉑或者吉西他濱加奧沙利鉑。
肝細胞癌與肝惡性腫瘤為從屬關係，區別如下：1、肝細胞癌屬於肝惡性腫瘤的一種，但肝惡性腫瘤範圍更廣，包括原發肝癌和繼發肝癌，原發肝癌又包括肝細胞肝癌和膽管細胞癌。繼發性如結腸癌肝轉移、肝臟淋 巴瘤、胰腺癌肝轉移，多認為是肝惡性腫瘤；2、肝細胞肝癌是原發於肝細胞的惡性腫瘤，是肝惡性腫瘤中最常見的一種，在原發性肝癌佔比大概為90%，大概10%是膽管細胞癌以及混合性肝癌，肝細胞性肝癌在肝惡性腫瘤佔50%-60%。
肝細胞分級是根據病理學分級進行，肝細胞癌Ⅲ級並非為晚期，僅代表肝細胞肝癌的分化程度。分化程度Ⅰ級為分化程度較好，Ⅱ級中等，Ⅲ級分化程度較差，分化程度越高代表惡性程度越高，但不代表肝癌晚期。Ⅲ級說明惡性程度相對較高，手術或其它治療後易復發轉移的可能性較大。小肝癌早期可能分級較低，也可能為Ⅲ級，若腫瘤較大或為瀰漫型腫瘤也可能是Ⅰ級或Ⅱ級。如果進行手術後發現是Ⅲ級，術後建議加用輔助治療降低腫瘤複發率。
肝癌消融後有無殘餘，需通過腫瘤指標、肝臟增強CT或磁共振進行判斷，具體如下：1、如果術前腫瘤指標異常，如甲胎蛋白較高，在1個月左右複查如果甲胎蛋白正常，結合CT或者磁共振沒有看到明顯腫瘤活性，說明射頻治療比較徹底；2、如果腫瘤指標較高，通過CT或磁共振檢查腫瘤有活性，說明射頻消融治療有殘餘。如果腫瘤＞5cm且腫瘤靠近大血管，則腫瘤位於較邊緣位置，通常不首選射頻消融，可考慮其它治療方法。