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與正中胸骨劈開的常規開放性手術相比，胸腔鏡下微創手術切除胸腺瘤，具有創傷小、手術時間短、手術中出血少、術後疼痛減輕、恢復快、併發症少、住院時間明顯縮短等優勢。患者術中肯定不會疼痛，因為這種手術都為全身麻醉，不存在疼痛問題。
目前多數胸腺瘤手術都為腔鏡微創手術，微創手術最大好處為術後恢復較快，因為其途徑微創，不是從正中劈開胸骨。醫生通過患者邊上的肋間做切口，將腫瘤切乾淨，沒有胸骨損傷，只是肋間有傷口。甚至為劍突下的腔鏡路徑，患者術後疼痛較輕，手術損傷少。
胸腺瘤術後化療仍存有爭議，少數人會選擇化療，多數人是術後不選用化療。胸腺瘤有侵襲性，侵襲性胸腺瘤復發概率大，若胸腺瘤在手術過程中有腫瘤殘留，即沒有切除乾淨，患者要進行化療。胸腺瘤化療與放療需聯合在一起，單用化療效果差，一般與放療聯合使用，降低腫瘤負荷，加強疾病局部控制。延長腫瘤復發時間，延長患者生存時間。
胸腺瘤在病理學上分為A型、AB型、B1型、B2型、B3型、C型。A型相對偏良性，C型為惡性胸腺癌，B2型已經排在偏後，因此B2型胸腺瘤治療效果不理想。B2型胸腺瘤為顯微鏡下淋巴細胞為主的一種胸腺瘤，在大量淋巴細胞背景下散在分佈空泡狀的圓形細胞，鏡下可見飽滿、帶有囊狀核或者清晰核仁的腫瘤細胞，患者 周圍血管基本正常。
良性胸腺瘤早期瘤體較小，通常患者沒有明顯不適。早期的小的胸腺瘤難以發現，因為患者沒有明顯症狀。瘤體長到一定程度以後，患者可以出現胸悶，胸前不適症狀。惡性胸腺瘤對周圍組織會有產生嚴重侵犯，侵襲性生長，患者早期會出現胸骨後疼痛、胸悶、氣急。如果患者出現轉移，會有相應不適。
病理學上，根據惡性腫瘤的分化程度，細胞異型性，細胞核分裂象，分裂象數目對惡性腫瘤進行分級，通常低級代表分化較好，惡性程度較低，高級代表分化差惡性程度高。惡性胸腺瘤在胸腺病理學上，病理分型分為A、AB、B1、B2、B3、C，而低度惡性胸腺瘤處於A或者AB型。
胸腺瘤大小不是評估胸腺瘤良惡性的標準，惡性胸腺瘤在病理上浸潤性生長，突破腫瘤包膜，胸腺瘤侵犯周圍臟器組織，並會出現遠處轉移。術後或者穿刺以後的病理切片，會明確告知腫瘤的良惡性。5cm胸腺瘤都不會為良性，惡性的胸腺瘤＞5cm。通常小的胸腺瘤生長緩慢，但是緩慢生長不一定為良性腫瘤，普遍認為胸腺瘤有潛在惡性傾向。因此，即使較小的胸腺瘤時間長，也會出現惡變趨勢。
胸腺瘤的良、惡性，並不一定依據胸腺瘤的大小來判斷，所以胸腺瘤＜5cm，不一定是良性。胸腺瘤是常見的前縱隔腫瘤，起源於胸腺組織，良、惡性可依據胸腺瘤的病理分型而定。通常胸腺瘤分為A型、B型、C型，其中B型又分為B1型、B2型和B3型，以及交界性AB型胸腺瘤。其中B1型胸腺瘤之前，屬於良性胸腺瘤，通常包膜完整、形狀規則、沒有外侵及浸潤性生長。
胸腺瘤主要分為A型、B1型、B2型、B3型、AB型和C型。其中A型、B1型存活率較高，10年生存率可達到90%以上，手術切除後效果較好。B2型手術術後，需做局部的輔助放療，10年生存率可達80%以上。而B3型胸腺瘤、C型胸腺瘤及胸腺癌，惡性程度較高，通常術後3年左右即會復發，5年生存率在60%左右。