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出現卵巢囊腫和子宮肌瘤，需確定良性和惡性。良性影響較小，多數患者可維持正常月經和生活；惡性影響較大，多以手術切除為主，輔以相應的放化療。良性卵巢囊腫需做卵巢囊腫剝除，保留正常卵巢組織；良性子宮肌瘤僅需剝除子宮肌瘤，保留正常子宮，惡性 子宮肌瘤和惡性卵巢囊腫，應切除相關卵巢和子宮，輔以放化療，且對人體損傷較大，恢復較慢。
卵巢在輸卵管下方兩側各有一個，卵巢囊腫有生理性和病理性之分。生理性囊腫可能是濾泡囊腫或黃體期囊腫，隨女性體內激素水平的調節而不斷變化。在月經乾淨後，囊腫會逐漸消失，通常無需手術。
卵巢囊腫在女性患者中是常見的卵巢腫瘤，手術時間會根據不同的患者、不同腫物性質做綜合判斷，通常手術時間在2-4小時之間。良性卵巢囊腫90%以上都是良性腫物。如果是沒有絕經的女性，通常都是做卵巢囊腫剝除術，將卵巢腫物剝除。為保留卵巢功能，還會把剩餘的卵巢 縫合，所以手術通常在2-3小時內完成。有時腫物會較大，剝除時間會較長。卵巢腫物之後要進行止血和縫合，通常在2-3小時之內就可解決。
生理性囊腫的特點是育齡期常見，左右會有變化，多在5cm以下。生理性卵巢囊腫主要發生於育齡期女性。只有在此期，卵巢才定期有卵泡發育、排卵、黃體形成。B超特點會隨月經週期改變，比如這個月是左側排卵，做超聲時會發現左側卵巢囊腫，而且大小多在5cm以下。現 在教科書上將其定在8cm以下，生理性囊腫能長到5-6cm，建議過3個月再複查一次。過3個月之後，有時左側囊腫消失，會發現右側又長出囊腫。這是因為這次變成右側排卵，排卵之後可形成右側卵巢黃體囊腫或者濾泡囊腫。
卵巢囊腫術後，患者一般休息1個月可以上班，但應根據囊腫的具體類型判斷。卵巢囊腫手術通常採取微創手術，若囊腫較大，無法完整取出，或者考慮黏液囊腫，或者不除外交界性腫瘤，術中有可能送冰凍切片，或者腫物上界超 過臍上三橫指，無法行腹腔鏡手術時，需要開腹手術。具體情況如下：