對於附睪炎和睪丸炎的治療方法主要是採用藥物進行治療，主要應用的藥物有頭孢類抗生素，如頭孢克肟或者是頭孢哌酮鈉舒巴坦鈉。由於附睪和睪丸的炎症比較頑固，一般口服抗生素效果不佳，因此患有附睪炎和睪丸炎都是應用抗生素進行靜脈輸液，輸液的時間一般也會比較長，大約在2周左右。在應用抗生素治療的過程中需要囑患者少活動，托起陰囊以減少疼痛。