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不建議選用維生素E治療口腔潰瘍。口腔潰瘍不是維生素E缺乏所引起的疾病，而且維生素E作為脂溶性維生素，過度服用有可能給身體帶來壞處，因為它會在體內瀦留。複發性口腔潰瘍的病因不明，可能與遺傳、免疫還有其他因素可能有一定關係 。現在對於單發或者偶爾發生的複發性口腔潰瘍，原則上還是局部治療為主，不太主張口服藥物治療。如果特別嚴重需要口服藥物，也應該在黏膜科醫生指導下選用藥物治療，可以選擇中藥比如口咽清顆粒，也可以選擇西藥比如沙利度胺。
口腔潰瘍散塗抹後不需要吐掉。通常塗在潰瘍表面上的藥物都可以嚥下去，有研究證明不會影響身體。如曲安奈德口腔膏、重組人表皮生長因子凝膠、康復新液、西帕依固齦等口腔黏膜常用的藥物，經驗證都沒有影響。還有如康復新 液、潰瘍散中的成分，在口服藥物中也經常用到。
口腔潰瘍在舌頭上確實疼痛明顯，常見為複發性口腔潰瘍，如輕型阿弗他潰瘍容易長在舌頭。舌頭容易受外傷，創傷後容易誘發複發性口腔潰瘍。可塗抹止疼藥，如局部利多卡因凝膠或奧布卡因凝膠，吃飯前或說話時局部麻醉即可。舌頭潰瘍不建議服用止疼藥 ，可塗曲安奈德口腔膏或重組人表皮生長因子凝膠保護潰瘍創面，也會減少疼痛。
口腔潰瘍不可以撒鹽在傷口上，鹽撒在口腔潰瘍上只能使潰瘍更加嚴重。正常的口腔黏膜都無法承受高濃度的鹽，口腔潰瘍時受損的黏膜更加無法忍受。在傷口上撒鹽不僅會加重疼痛感，使疼痛持續更長時間，高濃度的鹽還可能使周 圍黏膜受損，使潰瘍進一步加重或變為不典型。
口腔潰瘍常見的是複發性口腔潰瘍，與維生素C缺乏沒有明確關係。單純補充維生素C對治療口腔潰瘍的作用不大，如果不能均衡飲食，不吃蔬菜、水果，無法攝取維生素C，可以適當補充維生素C，能起到一定的輔助作用。